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ABI7900熒光定量PCR儀是繼7700、5700型熒光定量PCR儀之后,ABI公司新推出的高通量實時熒光定量PCR系統(tǒng)。它兼容96孔板和384孔板的熒光定量PCR儀,也可選手工進樣和自動進樣的熒光定量PCR儀。7900型熒光定量PCR儀可滿足從中通量到高通量實驗的需求。
7900型熒光定量PCR儀的主要特點:
高效平臺-7900系統(tǒng)是為支持高通量而構建的, 光學系統(tǒng)經(jīng)優(yōu)化以適用于384孔板熒光信號的激活和實時檢測。
結(jié)果可靠-7900系統(tǒng)采用了與7700、5700相同的定量原理,利用Ct值(Ct定義為在基線上方產(chǎn)生可檢測到的統(tǒng)計學上顯著的熒光發(fā)射的這一PCR循環(huán))和起始拷貝數(shù)的對應關系,通過外標準曲線精確計算未知樣品的起始拷貝數(shù)。
高度重現(xiàn)性-7900系統(tǒng)的熒光檢測發(fā)生在PCR對數(shù)期的起始,因此反應管中各組分沒有任何限制反應因素,從而確保檢測結(jié)果都是精確并能重復的。
先進的熒光檢測技術-RISM 7900熒光定量PCR系統(tǒng)在不降低速度、分辨率的情況下有效提高了產(chǎn)率,這是基于先進的熒光檢測技術:一束激光掃描并激活384個孔的每一個孔里的熒光染料,熒光信號通過光柵分光,經(jīng)過分離的多色熒光同時到達CCD攝像機,實現(xiàn)多色熒光同時檢測。
自動進樣裝置-7900系統(tǒng)配備有自動化配件可取得更高效率。自動化裝置可容納84塊384孔板,機械手臂可按一定順序?qū)⒋郎y樣品板運送至主機內(nèi),配備的條形碼閱讀器(Bar code reader)可自動識別進入主機的樣品板編號,使你在任何時間可以在樣品行列中插入或替代樣品板。
多樣的化學試劑-7900型熒光定量PCR儀上可使用的化學試劑包括TaqMan熒光探針法和SYBR Green熒光染料法。TaqMan探針法具有高度的靈敏度和特異性,適用于實時定量的多重反應或單核苷酸多態(tài)性分析(SNP)。SYBRGreen染料應用于目標鑒定(篩選測定)或者在只需用少數(shù)幾個反應的測定中更為理想。
有效防污染-7900系統(tǒng)在PCR全過程中使用專門設計的和始終密閉的樣品管。在加入樣品和試劑后這些管子便立即封閉并在擴增和檢測過程中保持這種狀態(tài),這樣就可以大大地減少污染的機會;此外,7900系統(tǒng)不存在PCR后處理,有效防止擴增產(chǎn)物對實驗環(huán)境的污染而造成的假陽性。
多種定量方法-ABIPRISM 7900序列檢測系統(tǒng)軟件為基因表達提供一種定量化方法。jue對定量是從一個標準曲線上直接測定目標(基因)的量。相對定量方法是通過與標定樣品相比較而計算未知樣品的量,不需要標準曲線。
1.jue對定量
為了測定未知樣品中的目標(基因)的數(shù)量,7900系統(tǒng)可用來測定樣品的CT,然后用一條標準曲線來測定起始的拷貝數(shù)。在標準曲線的繪制中,7900系統(tǒng)軟件首先用已知的起始拷貝數(shù)的幾種稀釋度計算它們的CT值。接著,軟件使用測得的CT值對應于起始拷貝數(shù)的對數(shù)值作圖。至少在五個數(shù)量級范圍中兩者呈線性關系。
2.相對定量
對于基因表達研究來說,相對定量是理想的方法。這里不是應用標準曲線而是相對于標定樣品計算表達水平。用一個內(nèi)源對照來標定樣品的量。這一方法與7900系統(tǒng)在一個多重反應中能同時對目標和內(nèi)源對照進行定量測定的能力相結(jié)合,可實現(xiàn)高效、高通量的基因表達研究。
3.有效的SNP檢測手段
除實時定量測定以外,7900系統(tǒng)包括對于已知的單一核苷酸多態(tài)性(SNPS)作大規(guī)模篩選的軟件。在一對等位基因系統(tǒng)中,用對應于兩個等位基因的兩個TaqMan探針在同一個試管中做多重PCR反應。反應終止時所產(chǎn)生的熒光用7900系統(tǒng)進行測定,實驗結(jié)果通過分析軟件迅速取得。
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